République Algérienne Démocratique et Populaire
Ministère de la Santé de la Population et de la Réforme Hospitalière

الجمهورية الجزائرية الديمقراطية الشعبية
وزارة الصحة والسكان واصلاح المستشفيات

 

Cours d’Introduction à la Bio-Informatique

L'Institut Pasteur d'Algérie organise du 19 au 23 octobre 2019 à l'annexe de Sidi Fredj un Cours d’Introduction à la Bio-Informatique

Ce cours est organisé conjointement par le Laboratoire d’Eco-Epidémiologie Parasitaire et Génétique Population de l’IPA et le ParSig de l’IPParis dans le cadre du projet Leisheild MATI RISE avec le soutient du C3bi (Center of Bioinformatics, biostatistic and integrative biology).

Organisé à travers une partie théorique et une partie pratique, le cours est dédié aux chercheurs et scientifiques de l’Institut Pasteur d’Algérie et des autres organismes algériens de recherche, afin de leur permettre d’accéder aux dernières connaissances en terme de séquençage et d’analyse de données générées par le séquençage haut débit.

La technologie NGS (Next Generation Sequençing) est la révolution biotechnologique de ces dernières années, qui permet de séquencer de grandes quantités d’ADN en un temps record. En effet, les techniques de séquençage ont bénéficié depuis quelques années d’innovations technologiques qui permettent   d’aborder le génome complet d’un individu, on parle alors de nouvelle génération de séquençage (NGS ou NextGen). L’évolution des performances et la baisse des coûts d’analyse par nucléotide suivent actuellement un rythme impressionnant, les conséquences sont une accélération des découvertes en génétique fondamentale, dans les mécanismes génétiques et dans la description des différents génomes.

Aujourd’hui, le frein n’est plus technique mais bio-informatique, ou comment analyser et gérer le flux considérable de données et obtenir une séquence fiable pouvant être utilisée en biologie à partir d’un gigantesque ensemble de séquences peu fiables.

 

Objectifs du cours :

  • Initiation des apprenants aux nouvelles technologies de séquençage
  • Acquisition de notions de bio-informatique
  • Renforcement des connaissances déjà acquises en bio-informatique en général
  • Initiation aux lignes de commandes LINUX
  • Initiation ou renforcement à l’utilisation de R
  • Initiation à la génomique, transcriptomique, métagénomique, phylogénomique et vue d’ensemble sur les autres technologies « omique » qui existent.

 

Encadrement scientifique :

Le staff d’encadrement du cours sera composé d’enseignants  bio-informaticiens du BioHub C3bi de l’Institut Pasteur de Paris et de l’Institut Pasteur de Tunis.

 

  • Gérald SPAETH (Chef de projet), Parsig, IPP
  • Giovanni BUSSOTTI (Responsable pédagogique, C3bi IPP)
  • Hervé MENAGER, C3bi IPP
  • Claudia CHICA, C3bi IPP
  • Fatma GUERFALI, IPT
  • Amel GHOUILA, IPT
  • Blaise LI, C3bi, IPP
  • Etienne KORNOBIS, C3bi, IPP

Public ciblé :

Ce cours est destiné aux scientifiques biologistes de l’IPA et des autres organismes de recherche algériens, désirant s’initier à la bio-informatique et aux technologies NGS, de la génération de données à leur analyse complète.

Langue d’enseignement :

Le cours sera dispensé en Anglais et en Français

Durée et dates de la formation :

05 jours, du 19 au 23 octobre 2019

Lieu de la formation :

Institut Pasteur d’Algérie, annexe de Sidi-Fredj , Alger (en face du Village africain)

Nombre de participants :

20 personnes (50% issus de l’IPA)

 

Frais d’inscription :

  • Pour les candidats externes à l’IPA :

Tarifs :

- 20.000 DA TTC  
les tarifs incluent :  frais pédagogiques , de documentation, restauration et pauses-café)

 - Pour les candidats salariés de l’IPA : Formation gratuite

Possibilité d'hébergement sur place pour les candidats hors wilaya d'Alger (Tarifs et modalités de paiement, prendre contact avec le département de l'IPA: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

 

Date limite de dépôt des candidatures :

Dimanche 11 Août 2019

 Comité d’organisation :

  • Dr Harrat Zoubir, Chef du Laboratoire LEEPGP ;
  • Mme Kherachi Ihcen biologiste Laboratoire LEEPGP (coordinateur local) ;
  • Mr Garni Rafik biologiste au Laboratoire LEEPGP ;
  • Melle Benbetka Sihem biologiste Laboratoire LEEPGP ;
  • Mr Benallal Kamel Eddine biologiste Laboratoire LEEPGP ;
  • Mme Rihane Louiza formation : moyens pédagogique;
  • Mme Sedira Lydia DLRD diffusion internet ;
  • Mme Nedir Sonia DLRD évaluation du cours ;
  • Mme Ait Mesbah Sihem Annexe de Sidi Fredj Accueil, hébergement et restauration
  • Mr Berkane Khaled DMIM moyens logistiques.

 

 Modalités d'inscription : candidature à déposer en ligne en cliquant ici :  https://forms.gle/BPmLfA3VRVuqB89u9

 

Les candidats retenus seront prévenus par e-mail à la mi septembre